Celem badania jest identyfikacja obecności DNA Treponema pallidum w badanym materiale diagnostycznym.

Badanie w kierunku kiły metodą PCR jest wykonywane w celu identyfikacji materiału genetycznego bakterii Treponema pallidum, która jest odpowiedzialna za rozwój kiły. Badanie to jest często wykorzystywane w diagnostyce kiły w przypadkach, gdzie konieczne jest potwierdzenie obecności bakterii.
Jeśli wyniki testów serologicznych na kiłę (takich jak test VDRL lub test TPPA) są niejednoznaczne lub negatywne, a nadal istnieje podejrzenie kiły, badanie PCR może być użyte do bardziej bezpośredniej identyfikacji bakterii.
Badanie to wykonuje się także przy monitorowaniu skuteczności leczenia. Po zakończonym leczeniu, zmniejszenie ilości materiału genetycznego bakterii w organizmie może świadczyć o skuteczności terapii.