Mikrobiom PCR z analizą funkcjonalną mikrobiomu to kompleksowe badanie pozwalające określić skład mikrobiomu oraz ocenić jego potencjalne funkcje metaboliczne.

Badanie wykorzystuje analizę PCR oraz sekwencjonowanie DNA III generacji (long-read). Pozwala na identyfikację bakterii, grzybów i pasożytów oraz ocenę różnorodności mikrobiomu.

Integralną częścią badania jest analiza funkcjonalna z wykorzystaniem algorytmu PICRUSt2, która ocenia potencjał mikrobiomu w 13 obszarach, m.in.:

produkcja krótkołańcuchowych kwasów tłuszczowych (SCFA),
metabolizm witamin z grupy B,
metabolizm węglowodanów i funkcjonowanie bariery jelitowej,
metabolizm kwasów żółciowych i estrogenów,
metabolizm szczawianów,
metabolizm choliny i TMAO,
oś mikrobiom–mitochondria,
metabolizm siarki i H₂S,
LPS i biofilm,
psychobiotyki i neuromodulatory,
metabolizm białek i azotu,
metanogeneza,
potencjał metaboliczny związany ze składnikami diety.

Dzięki temu badanie pokazuje nie tylko „kto” tworzy mikrobiom, ale również jakie funkcje metaboliczne może potencjalnie realizować.

Wynik analizy funkcjonalnej stanowi predykcję potencjału mikrobiomu na podstawie jego składu genetycznego i nie jest bezpośrednim pomiarem aktywności metabolicznej. Powinien być interpretowany w kontekście indywidualnej sytuacji pacjenta.

Mikrobiom PCR z analizą funkcjonalną to pogłębiona ocena mikrobioty, która łączy analizę jej składu z oceną potencjalnych funkcji metabolicznych.